食物中毒与流行性传染病的根本区别在于是否具有传染性，此外，二者在病因、治疗方式等方面也存在区别。
1、是否具有传染性：食物中毒是指摄入了含有生物性、化学性有毒、有害物质的食物后出现的一种急性或者亚急性疾病，通常不具有传染性。流行性传染病是指由各种致病性微生物或病原体引起的疾病，具有传染性。因此，食物中毒与流行性传染病的根本区别就在于是否具有传染性。
2、病因：食物中毒的病因包括生熟交叉污染、食品贮存不当、食用有毒有害食品、误食误用等，主要表现为恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，还可能伴有头痛、头晕、意识模糊等症状；流行性传染病主要是细菌、真菌、衣原体、病毒等病原体感染人体后引起的，包括很多种疾病，也可以表现为多种症状。
3、治疗方式：如果出现食物中毒，临床上，可以采用催吐、洗胃、机械通气等方式进行治疗，还可以配合使用颠茄片、消旋山莨菪碱片等解痉药物，或者盐酸苯海拉明片、氯雷他定片等抗组胺药物进行治疗。流行性传染病因为其具有流行性和传染性，首先需要进行隔离，切断传染途径，然后使用对应的药物杀灭对应的病原体。
