有褐色分泌物、小腹微痛、腰疼可能是排卵期出血、盆腔炎、子宫内膜炎、子宫腺肌病、子宫肌瘤等因素引起的，女性需要及时到医院就诊，并且配合医生对症治疗。
1、排卵期出血：在排卵期，体内激素水平变化可能导致少量出血，可伴有轻微腹痛和腰疼。一般无需特殊用药，注意休息即可。
2、盆腔炎：炎症刺激可引起褐色分泌物、小腹疼痛和腰疼，常伴有坠胀感等症状。女性可以按照医嘱使用甲硝唑片、左氧氟沙星片等药物进行治疗。
3、子宫内膜炎：子宫内膜发炎可导致上述症状，常有白带增多等表现。女性可以按照医嘱使用头孢克肟胶囊、阿奇霉素片等药物进行治疗。
4、子宫腺肌病：可出现月经异常、疼痛等症状，表现为褐色分泌物、小腹及腰疼。女性可以按照医嘱使用吲哚美辛胶囊、达那唑胶囊等药物进行治疗。
5、子宫肌瘤：肌瘤可能影响子宫正常功能，引起异常出血和疼痛等。女性可以按照医嘱使用米非司酮片、达那唑胶囊等药物进行治疗。
建议女性注意个人卫生，避免过度劳累，定期进行妇科检查。
