一般情况下，月经后5天，有褐色分泌物、腰疼，可能是生理性原因或病理性原因引起的，需要根据实际情况进行处理。具体分析如下：
一、生理性原因
如果女性的月经周期相对不是很规律，在月经结束后5天可能会出现排卵的情况，也会出现月经后5天，有褐色分泌物、腰疼的症状，若无其他不适症状，属于一种正常的生理现象，一般是不需要特殊治疗的，女性不必过分担心。
二、病理性原因
1.阴道炎：阴道黏膜受到细菌感染容易引起阴道炎，常伴有分泌物增多的症状，也会出现月经后5天，有褐色分泌物、腰疼的现象。女性可以遵医嘱使用复方黄柏洗液、甲硝唑栓等药物进行治疗。
2.盆腔炎：病原菌感染容易引起盆腔炎，常伴有盆腔充血的症状，可能会出现月经后5天，有褐色分泌物、腰疼的现象。女性可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素胶囊等药物进行治疗。
日常生活中，女性应当注意保持局部的干燥、清洁，饮食尽量以清淡为主，少吃辛辣刺激性食物。
