早上醒来吸一根烟的危害有咽喉不适、损伤大脑、增加患癌风险等。具体情况分析如下：
1.咽喉不适：早上醒来，身体经过长时间的睡眠，体内的水分消耗比较大，容易出现喉咙干痒、缺水等症状，吸烟可能会加重咽喉不适，导致患者出现咽喉肿痛、咳嗽、痰多、干呕等症状。
2.损伤大脑：早上醒来，身体处于缺氧的状态，吸一根烟，可能会降低血液当中的氧气的含量，导致脑供血不足或者脑血管堵塞，从而损伤大脑，导致大脑皮层变薄。
3.增加患癌风险：早上醒来，肺部的血液循环还不够通畅，香烟的毒素和杂质被肺部吸入，短时间很难排出，从而堆积在人体内产生造成更多的肺部损伤，患肺癌的风险也会随之增加。
