如果胎儿基因突变，一般孕检能查出来，可以做羊水穿刺、无创DNA、唐氏筛查等检查，具体分析如下：
1.羊水穿刺：羊水穿刺主要是通过穿刺针穿破腹壁进入子宫，抽取部分的羊水做化验，羊水穿刺能够通过羊水细胞染色体，判断出胎儿是否有畸形、染色体异常等现象，从而明确胎儿是否存在基因突变的情况，在检查之后可能会出现伤口感染，因此要注意护理。
2.无创DNA：无创DNA通常用于胎儿染色体检查，通过抽血检查的方式做相关检测，从而明确是否有基因突变以及基因缺失等异常情况。
3.唐氏筛查：唐氏筛查主要是左腹腔抽血，检查母体与外周血液的血清指标，根据检查结果判断是否有染色体疾病，可以检查出胎儿是否患有先天性或者遗传性疾病，从而明确胎儿是否存在基因突变的情况。
