12岁孩子月经16天了还不干净的原因包括内分泌失调、青春期功血、子宫肌瘤、子宫内膜炎、血液系统疾病。建议及时就医，根据原因遵医嘱治疗。
1、内分泌失调：12岁刚步入青春期，下丘脑-垂体-卵巢轴尚未完全成熟，激素分泌不稳定，雌激素水平波动大，子宫内膜不能规律脱落，导致月经淋漓不尽。可通过调整生活方式，规律作息、避免熬夜，适当运动，保持心情舒畅。若症状持续，可在医生指导下使用短效避孕药调节，如屈螺酮炔雌醇片、去氧孕烯炔雌醇片、炔雌醇环丙孕酮片，帮助稳定激素水平。
2、青春期功血：青春期功能性子宫出血多因内分泌紊乱引起，无排卵使得子宫内膜受单一雌激素刺激，不断增生，缺乏孕激素拮抗，内膜脆弱易出血且难止血。可遵医嘱使用孕激素止血，如黄体酮胶囊、地屈孕酮片、醋酸甲羟孕酮片，使子宫内膜转化，达到止血目的，后续还需调整周期。
3、子宫肌瘤：虽在青少年中少见，但也有发病可能。肌瘤影响子宫收缩，使血管不能有效闭合，导致出血不止。较小肌瘤可定期观察，若肌瘤较大或症状严重，可能需手术治疗，如肌瘤剔除术。在此期间，要注意避免剧烈运动，防止肌瘤扭转等情况，可服用宫瘤消胶囊、桂枝茯苓丸、红金消结片辅助控制肌瘤生长。
4、子宫内膜炎：不注意个人卫生，经期使用不洁卫生用品等，细菌感染子宫内膜引发炎症，炎症刺激使局部血管通透性增加，血液渗出，月经延长。可口服抗生素治疗，如头孢克肟胶囊、阿奇霉素片、盐酸多西环素片，同时注意经期卫生，勤换卫生巾，保持外阴清洁。
5、血液系统疾病：如血小板减少性紫癜、白血病等，会影响凝血功能，导致月经出血不易止住。需针对具体血液疾病进行治疗，如血小板减少性紫癜可使用糖皮质激素，如泼尼松片、地塞米松片、甲泼尼龙片，提升血小板数量，改善凝血，同时配合输注血小板等治疗，具体依病情而定。
12岁孩子出现月经长时间不干净，家长务必重视，及时带孩子就医，进行妇科超声、血常规、性激素六项等检查，明确病因后在医生指导下规范治疗，切勿自行用药，以免影响孩子生长发育。同时，要关注孩子心理健康，给予关心和支持。
