胃肠炎患者一般可在医生指导下使用青霉素类、头孢菌素类、硝基咪唑类、大环内酯类等抗生素。
1、青霉素类抗生素：该类药物主要是指能破坏细菌的细胞壁并在细菌细胞的繁殖期起杀菌作用的一类抗生素，一般是由青霉菌中提炼而来。若是出现胃肠炎，存在细菌感染，通常可以使用该类药物，较为常见的有注射用青霉素钠、阿莫西林胶囊等。
2、头孢菌素类抗生素：青霉素是一类广谱的抗菌药物，若患者对该类药物过敏，通常可以在医生指导下选择头孢菌素类抗生素代替。该类药物如头孢拉定、头孢克肟、头孢呋辛酯等，是以冠头孢菌培养得到的天然头孢菌素C作为原料，经半合成改造其侧链而得到的一类抗生素。其抗菌效果较强，能够有效抑制病菌增殖，可缓解细菌感染引起的胃肠炎症反应。
3、硝基咪唑类抗生素：该类药物一般以甲硝唑片、替硝唑片较为常见，主要是可以通过分子中所含有的硝基，在无氧环境中，发生还原反应，从而起到杀灭病原菌的功效，临床上对于厌氧菌引起的胃肠炎有较好的治疗效果。
4、大环内酯类抗生素：患者还可以选择大环内酯类抗生素。该类药物是一类分子结构中具有12-16碳内酯环的抗菌药物的总称，通常通过阻断核糖体中肽酰转移酶的活性，达到抑制细菌蛋白质合成目的，可以起到较好的抑菌效果。常见类型如罗红霉素、阿奇霉素等，主要用于治疗需氧革兰阳性球菌和阴性球菌、某些厌氧菌、支原体、衣原体等感染引起的胃肠炎。
除此之外，还可以使用喹诺酮类抗生素，由于该药物治疗的病症较多，部分患者可能会对药物产生一定的过敏反应，此时在医生指导下使用，可以有效地降低过敏反应出现的概率，保护患者的身体健康。
