中药跟褪黑素一起吃了头疼可能是药物不良反应、用药剂量不当、过敏因素导致，需要及时停药或调整药物，必要时可在医生指导下用药治疗。具体分析如下：
1、药物不良反应：褪黑素可以起到抗氧化、改善睡眠的效果，能够增加睡眠质量，延缓衰老，褪黑素服用过程可能会引起副作用，和中药一起服用有可能会产生药物不良反应，引起头痛。应该及时停止服药，先喝中药治疗疾病，中药停止后再吃褪黑素。
2、用药剂量不当：中药跟褪黑素一起吃头痛也可能是用药剂量不当的原因，比如用药过量或用药太频繁会导致中枢神经紊乱和受损，引起头痛。应该在医生指导下减轻药物剂量。
3、过敏因素：中药跟褪黑素一起吃了头疼也可能是过敏因素，通常是对某种药物成分出现了过敏反应，造成头痛、头晕、胸闷等症状。可遵医嘱口服氯雷他定片、盐酸西替利嗪胶囊等药物。
中药跟褪黑素尽量不要同时服用，需要根据病情的轻重缓急适量用药。
