一般情况下，支原体肺炎患者住院十二天还咳嗽的厉害，脸上还起蜂疤可能是饮食不当、病情加重、过敏等原因导致的。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
1.饮食不当：支原体肺炎是肺炎支原体引起的急性呼吸道感染伴肺炎，常会引起咳嗽、头痛、皮疹等症状，如果患者在治疗期间没有注意饮食结构，常吃辛辣、生冷、油腻等刺激性食物，通常会刺激气道，加重咳嗽，影响患者恢复。建议患者改善饮食结构，以清淡、易消化的饮食为主。
2.病情加重：支原体可以在呼吸道上皮细胞上长期寄存，既能够通过患者来吸取自身所需要的营养物质，也可以逃避黏膜纤毛的清除作用和吞噬细胞的吞噬作用，进而可能会加重病情。患者可以在医生指导下使用红霉素片、阿奇霉素片、罗红霉素片等药物进行治疗。
3.过敏：如果患者在治疗期间接触了花粉、动物毛发等过敏原，可能会引起过敏反应，从而容易出现咳嗽、呼吸困难、皮疹等症状，建议患者远离过敏原，并在医生指导下使用盐酸西替利嗪片、盐酸左西替利嗪口服溶液、马来酸氯苯那敏片等药物进行治疗。
