同房后三天小腹疼痛，可能是盆腔炎、子宫内膜炎、黄体破裂、卵巢囊肿扭转、胃肠道痉挛等原因引起的，建议及时就医并遵医嘱治疗。
1.盆腔炎：同房时若男女双方未注意卫生，细菌、支原体等病原体易侵入女性生殖道，上行感染引发盆腔炎。炎症刺激盆腔组织，导致小腹持续性疼痛，常伴有坠胀感，活动、性交后加重，还可出现白带增多、异味，发热等症状，需及时就医，使用抗生素抗感染治疗。
2.子宫内膜炎：同房过程中，外界病原体入侵或女性自身阴道、宫颈炎症蔓延，累及子宫内膜，引发炎症。子宫内膜充血、水肿，出现小腹疼痛，多为隐痛或胀痛，在月经期间疼痛可能加剧，同时月经量增多、经期延长，应遵医嘱足量足疗程用药治疗，防止病情迁延。
3.黄体破裂：女性在排卵后形成黄体，黄体囊肿壁较薄，同房时腹部受到外力撞击、挤压，或因剧烈运动等因素，可能导致黄体破裂。患者突然出现一侧小腹剧痛，短时间内可扩散至整个下腹，伴有恶心、呕吐、头晕、乏力等，严重时可因大量出血导致休克，需立即就医紧急处理。
4.卵巢囊肿扭转：若女性患有卵巢囊肿，尤其是中等大小、蒂较长的囊肿，同房时体位突然改变，囊肿蒂部发生扭转，使囊肿缺血、坏死，引发剧烈疼痛，常表现为一侧下腹绞痛，难以忍受，还伴有恶心、呕吐，需尽快手术解除扭转，挽救卵巢功能。
5.胃肠道痉挛：同房后腹部受凉、精神紧张或饮食不当等，可能诱发胃肠道痉挛，引起小腹疼痛，疼痛性质多为阵发性绞痛，部位多在脐周或下腹部，可伴有恶心、呕吐、腹泻等消化系统症状，一般通过休息、热敷、饮用温水等方法可缓解。
若同房后小腹疼痛持续不缓解或加重、伴有发热、阴道出血等异常，务必及时就医，遵医嘱用药、检查。日常注意同房卫生，保持外阴清洁，避免过度劳累，定期妇科检查。