左侧卵巢的囊肿长度为5厘米，若为良性囊肿，通常情况下并不算太严重。但是，如果囊肿的性质是恶性的，情况会比较严重。
如果左侧卵巢囊肿是良性的，通常会称其为生理性囊肿。这种囊肿可能是卵巢黄体囊肿，或者是卵巢滤泡囊肿。这些囊肿的大小通常在2-3厘米之间，甚至可能长到5厘米。只要不对患者的身体健康产生不良影响，就可以进行持续的随访观察，通常情况下并不是特别严重。然而，当囊肿不断扩大，并在后期超出5厘米时，建议首先进行手术切除，随后进行病理学检查以确定其是良性还是恶性，如果囊肿的检查结果是良性，通常情况下也不会太严重。
如果左侧的卵巢囊肿长度达到5厘米，并且囊肿的性质被判定为恶性，同时肿瘤标记物的数值也会上升，这种情况很可能是病理性囊肿。如果不及时进行卵巢囊肿的剔除手术，可能会导致囊肿发生扭转或者破裂，这种情况相对而言是比较严重的。
