吃避孕药第三个月忽然不来月经可能是怀孕、内分泌失调、多囊卵巢综合征等原因造成的，可对症治疗。
1、怀孕：因为吃避孕药成功的概率通常在85%到99%，不具有100%的概率，所以当女性吃避孕药出现避孕失败的情况，因受孕就会出现停经10天以上的情况，以及还可能伴随头晕、乏力、嗜睡等早孕反应，此时需注意多加休息，可及时就医了解是否怀孕。
2、内分泌失调：如果女性吃避孕药的这段时间过度劳累，造成内分泌失调，导致体内激素水平变化较大，就可能有忽然停经的表现，还可能伴随易怒、多汗、畏寒等症状。需在平时注意劳逸结合，保证睡眠充足，注意保持情绪稳定，就有助于逐渐改善。
3、多囊卵巢综合征：受到遗传、营养过剩等多种因素影响就可能诱发多囊卵巢综合征，导致女性有多毛、脱发、月经异常等表现，在吃避孕药期间病情发作一般不会影响症状表现。建议女性注意养成健康的生活习惯，可在医生指导下使用地屈孕酮片、来曲唑片等药物改善激素水平，调理月经。
除以上常见原因外，还有相对常见的原因，如子宫内膜炎、子宫内膜异位症、甲状腺功能减退、子宫肌瘤、卵巢早衰等，可根据实际情况及时就医治疗。
