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小肠穿孔手术后两年脓肿消炎后可能还要手术，一般需要根据创口是否裂开进行判断，具体分析如下：
小肠穿孔手术后两年，出现脓肿，在消炎之后需要观察创口是否裂开。如果创口裂开，可能会导致感染加重，通常需要通过手术清创同时进行二次缝合。如果创口尚未裂开，出现轻微炎症感染，或者脓肿，在消炎之后，通常可以达到较好的治疗效果，无需进行手术治疗。
出现脓肿时，说明发生感染，日常饮食中，通常需要避免食用过度辛辣刺激性的食物，否则可能会导致感染加重，不利于脓肿的恢复。