藏毛窦通常不能自愈，患者应积极配合医生进行治疗。
由于毛发已经生长到皮肤内，如果不排出毛发，藏毛窦会反复肿痛、流脓，无法自愈。即使脓液排出，暂时缓解疼痛，但当身体变弱时，还会再次发作，甚至范围会更大，会向头侧或者肛门扩散，形成更大的脓肿。所以，藏毛窦一般不能自愈。
藏毛窦是皮肤的小孔或空腔，主要位于臀缝上方或其附近。藏毛窦常包含有毛发、皮肤碎片或污垢。藏毛窦和藏毛囊肿都属于藏毛病的范畴。只形成窦道的话就叫做藏毛窦，出现感染、化脓的话还会形成藏毛脓肿。
本病多表现为局部皮肤的凹坑，位于臀缝上方或其附近，可看得到藏毛窦的小孔、开口。出现感染的时候，藏毛窦可能会有发红、疼痛、肿胀等表现。若患者没有任何不舒服，可以选择保守治疗，主要就是做好防护，例如注意局部清洁、干爽、透气，少摩擦，勤剃毛。
若出现明显不适，患者需要遵医嘱使用抗生素，如果疼痛明显，可能需要短期用止痛药物，例如对乙酰氨基酚片或布洛芬缓释胶囊等。针对反复出现的、复杂的或者严重的藏毛窦，可能需要手术治疗。
