甲型流感的患者出现头疼一般是正常的，多考虑是神经刺激，血管扩张引起的，注意休息可逐渐改善，必要时可遵医嘱使用药物缓解。
甲型流感是由甲型流感病毒感染所致的一种急性呼吸道传染病，能感染人类并引起一定范围流行的主要有甲型H1N1流感病毒和甲型H3N2流感病毒。上述病毒侵入人体后，可导致发热，而发热时，身体内部会产生许多有害代谢产物，如乳酸、二氧化碳、钾离子等，进一步刺激神经系统，引起神经痛觉反应，出现头疼的现象，所以一般属于甲型流感的正常反应。另外，发热时交感神经兴奋，体内分泌出大量的儿茶酚胺，该物质可作用于神经，导致血管扩张，从而引发头疼。
出现头疼的患者还可能伴随发热、咽痛、咳嗽、咳痰等不适症状，一段时间的休息后，部分患者可逐渐改善，患者也可以遵医嘱服用布洛芬片、对乙酰氨基酚片等药物，抑制前列腺素的合成，缓解头疼。治疗期间多休息，保证充足的睡眠，保持室内空气清新，多补充水分，加速新陈代谢，促进病情恢复。
