肛门附近有小坑可能是生理性因素导致的，也可能是感染、肛瘘等病理性因素导致的，如果患者出现不适症状，建议及时就医，可以做视诊、触诊、腹部CT等相关检查，明确病因后采取相应治疗。
一、生理性因素
如果是肛门上方有一个小坑，比较浅，也没有症状产生，这并不是疾病导致的，而是尾椎骨的窝，属于正常的生理性现象，大部分人都有这个窝，通常不需要采取治疗。
二、病理性因素
1、感染：如果患者不注意肛门部位的清洁，在大便后没有擦干净粪便，可能会导致肛门有细菌滋生，引发感染，出现化脓性炎症，对皮肤造成损伤，出现小坑。如果炎症感染引发的皮损还未恢复，引发疼痛、瘙痒等不适症状，可以遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等抗菌药物治疗，缓解不适。
2、肛瘘：肛门附近的小坑可能是肛瘘，处于直肠及肛门的交界处，通常是因为肛门直肠有细菌感染，从而引起炎症化脓，化脓破溃后会形成肛瘘，是不易愈合的管状窟窿眼。建议就医检查，查看是否为肛瘘，如果被确诊，可以在医生指导下采取切开引流术或切开挂线术引流。
肛门附近的小坑，少部分可能是毛囊炎导致的，建议就医检查，明确病因后采取相应治疗。
