新冠一般是指新型冠状病毒感染，流感一般是指流行性感冒。头疼、发热、乏力有可能是流行性感冒引起的，如果患者的新型冠状病毒抗原检测为阳性，则可能是新型冠状病毒感染引起的。
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流行性感冒是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病，患者一般会出现高热、头痛、乏力、全身酸痛和结膜炎等症状，可以遵医嘱使用磷酸奥司他韦胶囊、扎那米韦等药物治疗。
若患者的新型冠状病毒抗原检测为阳性，则头疼、发热、乏力可能是新型冠状病毒累及多个系统引起的，患者可以遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等药物治疗头疼、发热，同时注意休息，保证充足的睡眠，有助于缓解乏力的症状。