通常情况下，驱蚊草被认为是安全的，对人类没有显著害处。不过也有少数时候，会产生一定的害处。
驱蚊草主要依靠其叶片、花朵或其他组织器官自然释放出特定香气或挥发性化合物来驱赶蚊虫。作为纯天然产物，通常对人类安全无害，故使用驱蚊草对人体无负面影响。驱蚊草散发出强烈的香气，尤其在高温时更为显著，可能会引发部分人的不适，干扰睡眠质量。并且，驱蚊草夜间进行呼吸时会消耗氧气，产生二氧化碳，如果在密闭如卧室的空间内摆放，可能会影响空气质量，与人争夺氧气。建议避免驱蚊草将放置在卧室、卫生间等封闭环境中，优选宽敞的开放式区域为佳。驱蚊草的种植需适度稀疏，尽管无害，但过浓的香气可能导致不适，甚至引发头痛、恶心等症状。特别是对过敏体质或呼吸道敏感者，可能引发不适反应，故建议此类人群避免在卧室放置驱蚊草。
若患者在接触驱蚊草后感到身体不适，务必立即寻求医疗帮助，并遵循医生的指导进行治疗。