咳嗽有痰、发热、流清涕可能是风寒感冒、甲型流感、新型冠状病毒感染等因素引起的，建议及时的进行针对性治疗。
1、风寒感冒：风寒感冒主要是由于身体感受风寒外邪以后肺失宣降引起的，多表现为恶寒重、流清涕、头痛、咳嗽、咳痰等。患者可遵医嘱使用感冒清热颗粒、伤风停胶囊等药物进行治疗，上述药物可以起到发散风寒的作用。
2、甲型流感：甲型流感是由甲型流感病毒感染引起的，病毒会刺激免疫系统，导致患者发热，刺激上呼吸道可导致患者流鼻涕、咽喉疼痛、咳嗽有痰等症状。患者可遵医嘱使用磷酸奥司他韦胶囊、玛巴洛沙韦片等药物治疗，起到抗甲型流感病毒的作用。
3、新型冠状病毒感染：该疾病会刺激体温调节中枢，导致患者发热，刺激鼻腔、咽喉黏膜导致患者流鼻涕、咽干、咽喉疼痛、咳嗽、咳痰等。可遵医嘱使用连花清瘟胶囊、双黄连口服液等药物治疗，起到清热解毒、表里双清的作用。
此外，该情况也可能是过敏性鼻炎、鼻窦炎、咽炎、喉炎等因素引起的，建议及时就诊治疗。