肩胛骨针灸后比另一边突出了通常不是针灸的原因，可能是骨质增生、脊柱侧弯或者风湿性关节疾病引起的，需要对症治疗。具体情况分析如下：
1、骨质增生：如果一侧肩胛骨有骨质增生会出现突出现象，会比另一侧的肩胛骨高出一些，可以在医生的指导下，使用活血化瘀的膏药治疗，比如麝香壮骨膏、通络去痛膏等。
2、脊柱侧弯：如果平时姿势不正确，会导致脊柱侧弯，使一侧的肩胛骨突出，看起来比较明显，可以到医院通过支具矫正。
3、风湿性关节疾病：如果有风湿性关节疾病可能会出现肿胀的情况，导致关节变形，而引起肩胛骨突出，可以在医生的指导下服用药物治疗，比如双氯芬酸钠缓释片、布洛芬缓释胶囊等。
