百会穴位于头部前正中线与两耳尖连线交汇的地方，将前发际至后发际的12寸区域划分为12个部分，其中上5寸即为百会穴所在的位置。在这个穴位上放些艾柱和艾灸盒即可。也可以将两个拇指置于耳尖这一位置，接着在两个中指交汇的位置，那便是百会穴所在。
在选择穴位时，建议采取坐姿，并在穴位附近用大拇指轻轻按压。在大部分情况下，可以观察到一个微小的凹陷区域，这时百会穴的具体位置就可以确定了。通过按摩百会穴，可以实现开窍醒脑、益气固脱、安神定志、升阳举陷、通督定痫等多种功效。不仅对头部疾患具有良好疗效，而且能改善全身气血运行，增强人体正气，提高机体免疫力。通过按摩百会穴，可以有效地治疗多种疾病，包括高血压、眩晕、耳鸣、血管性头痛、休克、心悸、失眠、健忘、神经衰弱、心律失常、脱肛、子宫脱垂、胃下垂、腹泻、遗尿、精神分裂症和癫痫等。
需要注意的是，务必警惕不要对婴幼儿进行百会穴的按摩，婴幼儿的囟门尚未完全封闭，因此对婴幼儿进行百会穴的按摩可能会对其脑部的神经和组织造成伤害。