睫毛根部疼痛可能是多种原因引起，如眼睑过敏、睫毛毛囊炎、睑缘炎等，需及时就医进行治疗。
1、眼睑过敏：如果患者的眼睛接触了某些过敏原，如花粉、灰尘、化妆品等，通常就可能会引起眼睑的过敏反应，导致眼睑炎症和睫毛根部疼痛。患者可以在医生的指导下使用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片、马来酸氯苯那敏片等药物进行抗组胺治疗。
2、睫毛毛囊炎：睫毛囊炎是指睫毛根部的毛囊发生炎症，可能与细菌感染、眼睑螨虫感染等有关。睫毛囊炎常伴随着睫毛根部红肿、疼痛、瘙痒等症状。患者可以在医生的指导下使用生理盐水进行清洗睫毛，并在周围涂抹红霉素眼膏来进行抗感染治疗。
3、睑缘炎：睑缘炎是指眼睑边缘的皮肤和毛囊发生炎症。这种炎症通常与细菌感染或其他因素，如油脂堵塞、眼睑螨虫有关。眼睑边缘的炎症和疼痛可能会扩散到附近的睫毛根部，从而引起睫毛疼痛的感觉。患者可以在医生的指导下使用硫酸庆大霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等药物进行抗感染治疗。
此外，出现该情况还可能是角膜炎、眼睑痉挛等原因引起的，患者可以去正规医院，在医生的指导下采取血常规检查、体格检查等来判断病情，对症治疗。