包茎上长了个小水泡可能是摩擦刺激、生殖器疱疹、包皮龟头炎、湿疹、珍珠状阴茎丘疹等因素引起的，建议患者及时前往正规医院就诊检查，通过日常护理、药物治疗、手术治疗的方式进行处理。
1、摩擦刺激：过度自慰、性生活过于剧烈或内裤材质粗糙等，出现包茎局部受到摩擦刺激，可能会出现小水泡，一般伴有轻微疼痛。处理方式主要是避免进一步刺激，穿着宽松柔软的内裤。通常无需用药，可自行恢复。
2、生殖器疱疹：生殖器疱疹由单纯疱疹病毒感染引起，病毒侵袭生殖器部位，出现包茎上长小水泡，常伴有疼痛、瘙痒症状。患者可在医生指导下外用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏、酞丁安乳膏等抗病毒药物。
3、包皮龟头炎：包皮龟头炎是由于包皮过长、不注意个人卫生等，细菌、真菌等感染引起的炎症，可能出现小水泡，常伴有红肿、分泌物增多、异味等症状。患者需要保持局部清洁，同时可在医生指导下外用克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏、莫匹罗星软膏等药物。
4、湿疹：湿疹是内外因素出现的皮肤炎症，发生在包茎部位时，会有小水泡形成，还会有红斑、丘疹、渗出等。患者可在医生指导下口服氯雷他定片、盐酸西替利嗪片、湿毒清胶囊等药物。
5、珍珠状阴茎丘疹：珍珠状阴茎丘疹多与生理发育变异有关，表现为环绕冠状沟的淡红色小丘疹，形似小水泡，一般无自觉症状，无需治疗。若患者有治疗需求，可在医生的指导下进行激光治疗，如二氧化碳激光、脉冲染料激光等，或者冷冻治疗。
此外，患者要注意个人卫生，避免不洁性行为，治疗期间避免性生活，有助于病情的恢复。
