附子理中丸和金匮肾气丸理论上可以一起使用，建议患者遵医嘱用药。
附子理中丸主要功效为温中健脾，适用于脾胃虚寒所致的手足不温、呕吐腹泻等病症；而金匮肾气丸具有化气行水、温补肾阳的功效，用于治疗肾虚水肿所致的小便不利、肢冷畏寒、腰膝酸软等病症。
当两者合用时，能够温中健脾、化气行水、温补肾阳，可用于治疗脾肾阳虚导致的系列症状，如消化不良、腰膝酸软、畏寒肢冷等。此外，附子理中丸和金匮肾气丸的药物成分互补，可以相互补充，共同发挥温阳作用，增强治疗效果。但是，这两种药物在组成成分、功效侧重点、主治疾病等方面存在区别，因此在实际使用中，需要根据个人病情和医生的建议来合理搭配使用。
同时，服用这两种药物时，也需要注意一些事项。例如，感冒发热病人不宜服用附子理中丸，服药期间忌不易消化食物；而金匮肾气丸则忌房事、生冷食物，孕妇忌服。此外，两种药物的服用时间也有所不同，一般建议附子理中丸饭前半小时嚼服，而金匮肾气丸则饭后半小时服用。
