怀孕40天上厕所有褐色分泌物，可能是宫外孕、先兆流产、阴道炎等原因导致的。孕妇可以到正规的医院进行检查，确定病因后积极配合医生进行治疗。具体内容如下：
1.宫外孕：受精卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠，一般会表现为腹痛、阴道流血等症状，血液混在分泌物里就会出现褐色分泌物，所以怀孕40天上厕所有褐色分泌物可能是宫外孕导致的。孕妇应及时到正规医院进行B超检查，如果是宫外孕引起的症状，需要及时终止妊娠，在医生的指导下使用米非司酮片、米索前列醇片等药物进行流产，服药后注意身体保养，避免流产对身体造成进一步伤害。
2.先兆流产：怀孕40天上厕所有褐色分泌物，可能是身体内的孕酮值过低，导致先兆流产而引起的症状。这种情况孕妇需要卧床休息，避免过度劳累，同时也要放松心情，避免情绪紧张，必要的情况下也可以在医生的指导下服用黄体酮胶丸、黄体酮胶囊、地屈孕酮片等药物进行治疗。
3.阴道炎：如果孕妇患有阴道炎，导致阴道黏膜破损，使血液从毛细血管中渗出，和分泌物混合后就可能会变成褐色，所以怀孕40天上厕所有褐色分泌物可能是阴道炎导致的，孕妇可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如苦参凝胶、克霉唑阴道片、硝呋太尔阴道片等，孕妇不能盲目用药，以免对胎儿的发育造成影响。
