男性尖锐湿疣通常可采取体格检查、皮肤镜检查、醋酸白试验、组织病理检查、HPV分子生物学检测等措施诊断。
1.体格检查：医生通过肉眼观察皮损的部位和形态，结合患者的病史进行分析。大多数尖锐湿疣临床表现典型，通过专科医生的肉眼辨认即可做出准确的诊断。如果存在肉眼可见的尖锐湿疣，通常不需要更多的检测就可以确诊。
2.皮肤镜检查：如果皮损过小，肉眼看不清，可能需要进行皮肤镜检查。皮肤镜检查能够观察到肉眼不易辨认的微小的尖锐湿疣，起到辅助诊断的作用。
3.醋酸白试验：用3%~5%醋酸外涂在皮损上，观察皮损的变化。如果皮损逐渐变白并稍隆起，则提示尖锐湿疣的可能性大。但醋酸白试验的特异性较低，偶有假阳性结果，因此主要用于判断尖锐湿疣可能累及的区域，进而对该区域进行进一步的治疗或检查。
4.组织病理检查：由医生选择典型的皮损进行局部麻醉，用手术刀切除小块病变组织，制成病理切片进行观察。如果表皮呈乳头瘤样增生伴角化不全，颗粒层和棘层上部细胞有明显的空泡形成，胞质着色淡，核浓缩深染，有凹空细胞，则可确诊为尖锐湿疣。组织病理检查是诊断尖锐湿疣的金标准。
5.HPV分子生物学检测：刮取少量皮损组织，通过核酸分子杂交、PCR技术等检测HPV-DNA。此方法虽然可以检测HPV感染，但并非尖锐湿疣的确诊方法。常用于诊断HPV的亚临床感染，为治疗提供参考。
男性尖锐湿疣在潜伏期可能难以检测出来，因为此时可能没有明显的皮损或症状，注意遵医嘱合理分析。
