感冒时病毒或细菌会侵犯扁桃体，所以会导致扁桃体发炎，根据感冒的性质不同选择不同的药物治疗扁桃体炎，具体如下：
1.病毒性感冒：若是病毒感染引起的感冒，病毒会侵犯扁桃体，导致咽部出现疼痛感，症状相对于细菌性感冒导致的扁桃体炎要轻，也不会出现较严重的全身症状。一般可使用抗病毒药物进行治疗，如利巴韦林颗粒、泛昔洛韦颗粒、蒲地蓝消炎口服液等。
2.细菌性感冒：细菌性感冒导致的扁桃体炎，临床上会出现咽部不适、有异物感、发干、痒、刺激性咳嗽等症状。建议患者首选青霉素或者头孢类的药物进行治疗，青霉素类药物包括阿莫西林、阿莫西林克拉维酸钾、氨苄西林等；头孢类药物包括头孢拉定、头孢克洛、头孢呋辛等。
患者平时要多喝水、多刷牙、多漱口，保持口腔的清洁卫生。若出现发烧的症状，可以使用解热镇痛类的药物进行治疗，如阿司匹林、布洛芬、双氯芬酸钠、对乙酰氨基酚等。
