冷冻治疗扁平疣是一种常见的治疗方法，但有时可能会留下黑色素沉着。处理该情况，可以采取涂抹药物、激光治疗、光子嫩肤、口服药物、注意防晒等方法。
1.涂抹药物：例如氢醌乳膏、维A酸乳膏、壬二酸乳膏等。氢醌乳膏能够抑制黑色素形成，分解已有的黑色素；维A酸乳膏可以促进表皮细胞更新，减少色素沉着；壬二酸乳膏对异常黑色素细胞有选择性作用，同时具有抗炎功效。适用于黑色素沉着较轻、面积较小的情况。对药物成分过敏者禁用，使用过程中可能会出现皮肤刺激、发红等不良反应。用药需遵医嘱，按照正确的剂量和方法使用。
2.激光治疗：通过特定波长的激光能量，击碎黑色素颗粒，使其被身体代谢掉。该方法针对性强，效果显著。适用于黑色素沉着较明显、面积较大的部位。皮肤炎症急性期、瘢痕体质、孕妇等慎用。治疗后可能会出现红肿、结痂等反应。
3.光子嫩肤：利用强脉冲光的选择性光热作用，改善皮肤色素沉着。可以同时改善皮肤的多种问题，如细纹、毛孔粗大等。适用于肤色不均、有多种皮肤问题的患者。患有光敏感疾病、近期使用过光敏药物、皮肤感染等情况禁用，治疗后需注意保湿和防晒。
4.口服药物：比如维生素C片、维生素E软胶囊、谷胱甘肽片等。维生素C和维生素E具有抗氧化作用，能抑制黑色素的形成；谷胱甘肽片可以参与体内氧化还原反应，减少黑色素生成。适用于全身皮肤色素沉着的调理。对药物成分过敏者禁用，长期大量服用可能会引起不良反应。
5.注意防晒：减少紫外线对皮肤的刺激，避免黑色素进一步加深。可以使用遮阳伞、遮阳帽、防晒霜等。适用于所有黑色素沉着的人群。但要选择合适的防晒产品，并正确使用。
需要注意的是，在选择治疗方法时，应根据自身的情况和医生的建议进行。其次，治疗过程中要注意观察皮肤的变化，如有异常应及时就医。另外，保持良好的生活习惯和心情，也有助于皮肤的恢复。