免疫荧光技术的基本原理主要是抗原抗体反应。
由于抗原抗体反应具有高度的特异性，当抗原抗体发生反应时，只要知道其中的一个因素，通常就可以查出另一个因素。免疫荧光技术是将不影响抗原抗体活性的荧光色素标记在抗体或抗原上，与其相应的抗原或抗体结合后，在荧光显微镜下呈现一种特异性荧光反应，通常具有敏感性强、特异性高、速度快的特点，是目前比较常用的组织学技术，也是比较精确的。
免疫荧光技术的要求很高，检查时载玻片及盖玻片要求干净、无杂质。进行荧光染色时，需注意染液的pH值、浓度和染色温度，还需要避免杂质的污染。
