脑透明隔囊肿是否会消失，要根据具体囊肿的大小进行分析。出现透明隔囊肿，主要考虑与局部积液堆积有关，所以要根据病情的严重程度针对性地选择治疗方案。
1、会消失：如果脑透明隔囊肿的体积比较小，没有产生明显的占位效应，通常后期随着局部积液的吸收，有自行消失的可能，不需要进行特殊处理；
2、不会消失：脑透明隔囊肿的体积比较大，往往代表局部积液堆积比较多，容易产生占位效应，要完全恢复比较困难，所以多数不能自行消失，需要及时进行治疗，比如通过手术的方法修复。
对于脑透明和囊肿的患者，如果体积并不是很大，注意定期进行随访，如果后期出现囊肿继续增大的现象需要立即就医处理，如果局部囊肿逐渐缩小，则说明病情在逐渐好转，有恢复的可能性。
