月经干净后两天同房后有褐色分泌物可能是月经残留、排卵期出血、宫颈息肉、子宫内膜炎、宫颈炎等原因所致。建议及时就医，遵医嘱处理。
1.月经残留：月经刚结束时，子宫和阴道内可能还有少量残留的经血，同房刺激可能导致此类残留血液排出，表现为褐色分泌物，可能伴有轻微下腹坠胀感。一般无需特殊处理，保持外阴清洁，观察分泌物情况即可。
2.排卵期出血：如果处于排卵期，体内激素水平变化可能引起少量子宫内膜脱落，出现褐色分泌物，一般持续2-3天，可伴有轻微腹痛。通常无需特殊处理，注意休息，保持外阴清洁。
3.宫颈息肉：宫颈局部组织增生形成息肉，同房时息肉受到刺激可能引起出血，表现为褐色分泌物。较小的息肉可暂不处理，定期复查；较大的息肉可能需要手术切除，以达到去除息肉的目的。
4.子宫内膜炎：细菌等病原体侵入子宫内膜引起炎症，可导致同房后出现褐色分泌物，还可能伴有下腹疼痛、发热等症状。可在医生的指导下使用左氧氟沙星片、妇炎康片等药物，发挥抗菌消炎的作用，改善子宫内膜炎症状。
5.宫颈炎：病原体感染宫颈，引发炎症，可出现同房后褐色分泌物，还可能伴有白带增多、异味等症状。可在医生的指导下服用抗宫炎片、妇科千金片、甲硝唑片等药物，具有清热祛湿、化瘀止带等作用，可缓解宫颈炎症状。
平时注意个人卫生，尤其是同房卫生，避免不洁同房。定期进行妇科检查，及时发现和处理妇科疾病。出现异常情况不要自行用药，应及时就医。
