真菌感染和细菌感染的区别主要为致病菌不同、引起的疾病不同、临床表现不同、用药不同，具体情况如下：
1.致病菌不同：引起细菌感染常见的病原菌是金黄色葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌、沙门菌、绿脓杆菌等；真菌感染的致病菌有霉菌、念珠菌、毛癣菌等。
2.引起的疾病不同：通常情况下，细菌感染可以引起毛囊炎、肺结核、流行性脑脊髓膜炎、疖痈等；真菌感染主要以癣为主，比如手足癣、头癣、甲癣、体癣等，同时念珠菌性阴道炎也属于真菌感染性疾病。
3.临床表现不同：细菌感染以局部红、肿、热、痛为主，有时还会伴随着高热的症状；真菌感染可以引起红斑、丘疹、脱皮、皮肤瘙痒等症状。
4.用药不同：细菌感染使用抗生素治疗，如青霉素、阿莫西林、红霉素、阿奇霉素等；真菌感染则需要使用抗真菌药物，如特比萘芬、伊曲康唑、克霉唑、酮康唑、咪康唑、益康唑等。
