一般情况下，头发里长了疙瘩，有疼痛感，可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿、疖肿等原因引起的，建议根据患者实际情况选择合适的方法来治疗，具体分析如下：
1.毛囊炎：机体抵抗力低下、病原菌感染等原因可能会引起毛囊炎，常伴有脓疱疮、局部四周有红晕等症状，可能会出现头发里长了疙瘩，有疼痛感的情况，可在医生的指导下外用盐酸环丙沙星凝胶、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。
2.皮脂腺囊肿：皮脂腺排泄管阻塞、痤疮等原因可能引起皮脂腺囊肿，常伴有囊肿、局部红肿等症状，可能会出现头发里长了疙瘩，有疼痛感的情况，可在医生的指导下通过皮脂腺囊肿切除术、二氧化碳激光等方式进行治疗。
3.疖肿：贫血、病原菌感染可能引起疖肿，常伴有炎症丘疹、疼痛等症状，可能会出现头发里长了疙瘩，有疼痛感的情况，可在医生的指导下服用二丁胶囊、盐酸克林霉素片等药物进行治疗。
