儿童阴茎短小通常不存在治疗的最佳时间。通常在5-6岁进行治疗比较好。
儿童阴茎短小是指阴茎外观正常、但长度小于同龄人平均长度2.5个标准差以上者。阴茎的长度与直径比值正常，可有阴茎海绵体发育异常，睾丸发育差或下降不全。能够导致儿童阴茎短小的原因有很多，主要与遗传因素、性激素分泌异常、肥胖等有关，也可能没有明确的病因。儿童阴茎短小进行体格检查时，通常会发现无阴囊，睾丸小、软、下降不全或缺如等畸形，肛门指诊检查通常会发现前列腺较正常人群小。
通常建议儿童在3-5岁时，及时前往医院的儿科进行治疗，明确病因后需要对症进行治疗，可以入院进行隐匿阴茎矫正术，彻底切除所有发育异常的肉膜及纤维条索，使阴茎充分显露，越早做手术越有利，因为随着年纪的增长，对于儿童的心理发育、生理发育都不利。
保持房间安静、整洁、舒适；保持良好的作息时间和生活习惯；经常参加体育锻炼，增强体质，避免肥胖，定期入院进行复查，了解机体的恢复情况。
