支原体感染可根据具体的支原体类型选择大环内酯类、氟喹诺酮类等抗生素进行治疗，具体的药物选择以医嘱为准。
支原体感染的情况下，早期遵医嘱使用适当的抗生素药物可减轻症状及缩短病程。通常大环内酯类抗菌药物为首选，如红霉素片、罗红霉素片和阿奇霉素片等。氟喹诺酮类药物也是可以的，如盐酸左氧氟沙星胶囊、加替沙星胶囊和盐酸莫西沙星片等，以及四环素类药物，如盐酸米诺环素胶囊、盐酸多西环素胶囊等用于肺炎支原体肺炎的治疗。因肺炎支原体无细胞壁，青霉素或头孢菌素类等抗菌药物无效。
致病支原体中，肺炎支原体可引起肺炎，人型支原体，解脲支原体和生殖器支原体主要引起泌尿生殖道感染。肺炎支原体无细胞壁结构，兼性厌氧，推荐遵医嘱使用四环素类药物。病原体通常存在于呼吸道纤毛上皮之间，不侵入肺实质。而生殖器支原体感染是一种性接触传播疾病，成人主要通过性接触传播，新生儿则由母亲生殖道分娩时感染，推荐遵医嘱使用大环内酯类、氟喹诺酮类都是可以的。
恢复期间要注意饮食清淡，避免吃辛辣刺激的食物。
