孕酮低但是有胎心胎芽可能是黄体功能不全、甲状腺功能减退、免疫因素影响、子宫内膜血流灌注不足、胚胎发育差异等因素所致，建议患者及时前往正规医院就诊检查，在医生的指导下选择日常护理、药物治疗的方式进行处理。
1、黄体功能不全：黄体功能不全通常是由于黄体分泌孕酮不足引起。孕酮水平低可能导致子宫平滑肌兴奋性增加，出现轻微腹痛等不适。患者可能还会有月经周期缩短、经量增多等症状。患者可以在医生的指导下服用地屈孕酮片、黄体酮软胶囊、烯丙雌醇片等药物进行保胎治疗。
2、甲状腺功能减退：甲状腺功能减退可能影响内分泌系统，导致孕酮合成减少。患者可能会感到乏力、怕冷、记忆力减退等。孕期甲状腺功能减退还可能影响胎儿发育。患者可以在医生的指导下服用左甲状腺素钠片进行治疗。
3、免疫因素影响：免疫功能异常可能干扰胚胎的正常发育，导致孕酮水平波动。患者可能无明显特殊症状，或有反复流产史。目前针对免疫因素的治疗较为复杂，需根据具体情况制定合理方案，可能会使用低分子肝素钠注射液、阿司匹林肠溶片等药物进行治疗。
4、子宫内膜血流灌注不足：子宫内膜血流灌注不足可能影响胚胎着床和发育，导致孕酮水平相对较低。患者可能出现月经量少、经期延长等症状。可以通过改善生活方式，如适当运动、避免久坐等，促进血液循环。若情况严重，可在医生的指导下使用丹参注射液等药物改善微循环。
5、胚胎发育差异：每个胚胎的发育速度和特点可能不同，可能在某个阶段出现孕酮低但胎心胎芽正常的情况。患者一般无特殊症状，但需要密切观察。此时应注意休息，避免剧烈运动和精神紧张，定期复查孕酮和超声检查，观察胚胎发育情况。
患者在孕期要保持良好的心态，避免过度焦虑和紧张。同时，要注意饮食均衡，多摄入富含蛋白质、维生素等营养物质的食物。而且要严格按照医生的要求进行产检，如有异常情况及时就医，遵医嘱进行治疗。
