洗手液具有消毒的作用，一般不能杀死真菌，不能代替药物治疗疾病使用。
真菌是一类真核细胞型微生物，包含许多种类。其中，致病性和机会致病性真菌在侵入人体后，可能导致人类感染性、超敏反应性及中毒性疾病。例如，湿疹、荨麻疹、支气管炎、肠炎、脑膜炎、脑脓肿等疾病都可能是真菌感染引起的。此外，部分真菌还具有致癌作用，可能会导致肝癌等疾病的发生，例如黄曲霉、棒状曲囊等。而洗手液是一种护肤清洁液，主要成分为表面活性剂、润肤保湿剂、增稠剂、pH调节剂、色素、香精等，主要作用是清洁手部，通过机械摩擦和表面活性剂的作用，配合水流或无水状态，以清除手上的污垢和附着的细菌。由于不含有杀灭真菌的成分，因此洗手液不可以杀死真菌。对于真菌感染导致的体癣、足癣、手癣、股癣、甲癣等皮肤病，患者需要在医生指导下选用抗真菌药物进行局部外用治疗，如硝酸咪康唑乳膏、复方酮康唑乳膏等进行治疗，以杀灭真菌，去除病因。
需注意的是，使用洗手液时不宜过量，以一泵为宜，过量使用可能导致摩擦搓洗过度，损伤手部皮肤。
