支原体感染是否会咽痛通常取决于具体的情况，可能会咽痛，也可能不会。
支原体感染通常是由支原体引起的感染性疾病，以呼吸道感染和泌尿道感染为主。临床上可以引起人类感染的支原体一般有肺炎支原体、生殖支原体、解脲支原体等。
肺炎支原体一般会通过呼吸道飞沫传播，如果患者未注意防护，可能会因为感染肺炎支原体引起咽痛、流鼻涕、耳痛等上呼吸道感染的症状。部分患者还可能会伴随乏力、发热等不适症状。
如果患者性生活较为混乱、未注意私处的清洁，可能会因为感染生殖支原体、解脲支原体等病原体诱发尿道炎、阴道炎等疾病，患者可能会出现尿频、尿道灼热感、排尿疼痛等症状，可能不会出现咽痛的情况。
大部分患者积极地配合医生进行治疗，并且注意日常护理，一般预后较为不错。建议患者尽早治疗，按照医嘱使用阿奇霉素分散片、罗红霉素分散片等药物进行治疗，通常可以起到抗感染的作用，进而促进身体的恢复。患者平时还需要注意休息，避免劳累，在恢复期间尽量少和人接触。