咳嗽且全身关节酸痛可能是病毒性感冒、细菌性感冒、流感、支气管炎、肺炎等原因导致的，患者需要及时到医院就诊，并且配合医生对症治疗。
1、病毒性感冒：病毒入侵人体后大量繁殖，释放毒素，刺激呼吸道引起咳嗽，同时影响全身，导致关节酸痛。患者可以按照医嘱使用抗病毒口服液、连花清瘟胶囊等药物进行治疗。
2、细菌性感冒：细菌感染人体引发炎症反应，炎症刺激呼吸道产生咳嗽症状，炎症介质作用于全身可造成关节酸痛。患者要注意个人卫生，可以按照医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等药物进行治疗。
3、流感：流感病毒感染人体后，引发强烈的免疫反应，一方面刺激呼吸道引发咳嗽，另一方面释放大量炎性因子导致全身关节酸痛。患者要多休息，可以按照医嘱使用奥司他韦胶囊、扎那米韦吸入粉雾剂等药物进行治疗。
4、支气管炎：炎症刺激支气管黏膜引起咳嗽，感染产生的炎症因子可引起全身关节酸痛。患者应避免吸入刺激性气体，可以按照医嘱使用阿奇霉素片、罗红霉素胶囊等药物进行治疗。
5、肺炎：肺部受到细菌、病毒等感染引发肺炎，肺部炎症刺激导致咳嗽，同时机体的炎症反应可引发全身关节酸痛。患者可以按照医嘱使用青霉素V钾片、头孢克洛胶囊等药物进行治疗。
患者应注意休息，保持室内空气清新，避免劳累。