无痛肠镜并不是真的无痛，患者醒后还是会有一定的感觉。
无痛肠镜主要是通过静脉注射麻药，通常是丙泊酚，可以抑制人体的中枢神经系统，使人体进入一种麻醉状态。当麻醉成功以后，在做肠镜时会往肠腔内注气，从而导致肠腔扩张、平滑肌痉挛。虽然患者处于麻醉中，不会产生痛觉，但是如果肠道扩张比较强烈，平滑肌痉挛，患者仍会有一些不自主的反应，比如抖腿、伸腿等。无痛肠镜只是一种简称，做不到真正的无痛，患者醒来以后还是会有腹痛、腹胀的感觉，并且有时腹痛会比较严重，所以无痛肠镜结束后需要密切观察。如果腹痛持续不缓解，这时需要做立位腹平片或者是CT检查，排除肠道穿孔的情况。
做完无痛肠镜后为了减少麻药的副作用，建议患者卧床休息6个小时以上，根据实际情况，适当的进食。