趴在桌子上午睡，起来后头疼可能和睡眠不足、受凉、姿势不当、颈椎病等原因有关。
1.睡眠不足：长期熬夜导致睡眠不足，使大脑过度疲劳，午睡不能较好改善，就可能在醒来后有头部不适的表现。建议患者养成作息规律的习惯，尽量不要熬夜，保证睡眠充足。
2.受凉：午睡的环境较为寒冷，因不注意身体保暖，造成头部受凉，引起血管收缩，出现胀痛的情况。可通过适度按摩缓解，做好身体保暖措施。
3.姿势不当：趴在桌子上睡觉，长时间保持一个姿势，导致头部的局部血管受到压迫，引起血液循环不畅，可能会有头疼、头晕等表现。起来后适度活动，在身体恢复正常血液循环后能逐渐缓解。
4.颈椎病：该疾病主要是颈椎退行性病变引起的，午睡起来病情发作，因神经根受到压迫，患者可能有头疼、乏力、肢体麻木等表现。可在医生指导下使用甲钴胺片、谷维素片等药物营养神经，还可配合医生进行牵引治疗。
此外，上呼吸道感染、高血压、脑膜炎等原因也可能引起上述现象，可及时就医检查了解。
