喝蒲公英水通常没有最佳时间，喝蒲公英水的时间可以根据个人情况和其功效特点来选择，患者应在中医医师的指导下用药。
蒲公英通常具有清热解毒、消肿散结、利湿通淋等功效。在夏季炎热时，人体容易内生热毒，出现咽喉肿痛、口舌生疮等症状，下午或晚上饮用蒲公英水可能较为合适。下午时段人体的阳气逐渐收敛，此时饮用蒲公英水可以帮助清除体内白天积累的热毒，且晚上人体处于相对安静的状态，有利于药物更好地发挥作用，缓解热毒症状。
对于一些有湿热症状的人，如舌苔黄腻、小便短赤等，早晨空腹饮用蒲公英水可能有一定益处。早晨人体的胃肠蠕动相对活跃，空腹时蒲公英水可以更直接地接触胃肠黏膜，促进胃肠的运化和排泄功能，有助于清除体内的湿热之邪，改善身体的不适症状。
需要注意的是，蒲公英性寒，虽然有诸多功效，但不宜过量饮用，尤其是脾胃虚寒者更要谨慎。患者在饮用蒲公英水时，要注意观察自身身体反应，如果出现不适症状应及时停止饮用。
