通常情况下，脚跟上方三厘米处疼痛可能与跟腱炎、跟腱后滑囊炎、外伤等原因有关，需对症治疗。具体分析如下：
1.跟腱炎：跟腱炎是指跟腱及周围腱膜产生的无菌性、炎症性病变，临床症状主要表现为局部疼痛、足跟不能着地、踝关节背伸疼痛加重等，所以脚跟上方三厘米处疼痛可能与跟腱炎有关。患者一般可以在医生的指导下使用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、尼美舒利颗粒等药物进行治疗。
2.跟腱后滑囊炎：跟腱后滑囊炎一般是指滑囊出现急性或慢性炎症，足跟后部位可能会有疼痛、压痛、局部肿胀等症状，所以脚跟上方三厘米处疼痛可能与跟腱后滑囊炎有关。患者一般可以去医院通过单纯跟骨后结节切除术、楔形截骨术等手术进行治疗。
3.外伤：外伤一般是指外力作用于人体，导致人体皮肤、肌肉、骨骼等出现损伤，如果患者脚跟上方三厘米处受到外伤，可能会有局部疼痛、皮肤红肿、局部出血等症状，所以脚跟上方三厘米处疼痛可能与外伤有关。患者一般可以在医生的指导下使用塞来昔布胶囊、伤科接骨片、云南白药胶囊等药物进行治疗。
