原发性闭经应根据病因进行治疗，常见的病因包括肥胖、先天性发育不良、营养因素、卵巢异常、阴道闭锁等。
1.肥胖：如果患者过于肥胖，可能会导致内分泌失调，进而导致月经不调、原发性闭经等。患者平时应适量吃一些清淡、低脂的食物，比如鱼肉、芹菜等，并且坚持体育锻炼。
2.先天性发育不良：与染色体有关，因为来月经应拥有功能性卵巢，有时卵巢是条纹状的肌肉组织，因此不具有分泌雌激素和孕激素的功能，子宫也不会发挥作用。患者在医生的指导下使用激素补充治疗，如结合雌激素片、戊酸雌二醇片等，还可以辅助生殖技术等。
3.营养因素：在青春期，此时激素波动已经很高，这可能会导致月经初潮延迟，最终导致原发性闭经。这种情况相对容易纠正。患者需要及时调整饮食结构，多吃富含蛋白质和维生素的食物，适量增加脂肪的摄入。此外，原发性闭经容易引起患者焦虑、抑郁等心理问题，必要时也可以进行心理治疗。
4.卵巢异常：包括原发性或先天性卵巢发育不全。由于卵巢功能差，不能分泌雌激素，子宫内膜不会发生周期性变化，导致原发性闭经。这类患者可以通过长期规律地服用雌、孕激素制剂来形成正常月经及维持第二性征，并尽可能促进生殖器官发育，常用药物包括枸橼酸氯米芬片、甲磺酸溴隐亭片等，患者应按照医嘱使用药物。
5.阴道闭锁：患者可能因为泌尿生殖窦及苗勒管末端发育畸形导致。患者可能会出现月经不来潮、下腹部坠痛等症状。患者通常可以通过人工阴道成形术、肠管法阴道成形术等方式进行治疗。
除此之外，还可能是生殖无能性营养不良症、阴道横隔、无孔处女膜、嗅觉缺失综合征等导致。若在婴儿期已发现发育不良，应及时到医院妇科就诊，尽快进行治疗和干预。
