药流一般指药物流产。药物流产第十二天有褐色分泌物可能是子宫收缩不良、宫腔残留、子宫内膜炎、盆腔炎、子宫肌瘤等原因所致。建议及时就医，遵医嘱处理。
1.子宫收缩不良：药物流产后子宫收缩欠佳可能出现褐色分泌物，还可能伴有恶露持续时间长等情况。可以在医生的指导下使用五加生化胶囊、产妇康洗液、缩宫素注射液等药物，能促进子宫收缩，加速恶露排出。同时，要注意休息，避免剧烈运动。
2.宫腔残留：若流产不完全，有组织残留在宫腔内，会导致褐色分泌物，还可能伴有腹痛等情况。可以在医生的指导下服用新生化片、少腹逐瘀颗粒等药物，促进残留组织排出。若残留组织较多，建议进行清宫术，将其清除。
3.子宫内膜炎：子宫内膜发炎可引起褐色分泌物，还可能伴有下腹疼痛、白带异常等情况。可以在医生的指导下使用奥硝唑胶囊、克林霉素磷酸酯片、妇炎康复胶囊等药物，具有抗菌消炎的作用。
4.盆腔炎：盆腔发生炎症可能出现褐色分泌物，还可能伴有腰骶部酸痛、坠胀等情况。可以在医生的指导下使用头孢地尼分散片、甲硝唑缓释片、妇科千金片等药物，具有抗菌消炎、清热除湿的作用。
5.子宫肌瘤：子宫肌瘤可能影响子宫正常功能，造成褐色分泌物，还可能伴有月经量增多等情况。应定期复查，观察肌瘤变化。必要时可以在医生的指导下服用消结安胶囊、小金胶囊、红金消结片等药物，具有活血化瘀、软坚散结的作用。若肌瘤较大或症状严重，可能需要切除肌瘤，保留子宫。
如果褐色分泌物持续不消失或伴有其他不适症状，应及时就医。同时，要注意个人卫生，按照医生的要求进行复查，以确保身体恢复正常。
