一般情况下，吃了厕所的小飞虫是否有病毒，需要根据实际情况来判断。具体分析如下：
厕所的小飞虫如果未咬过患有艾滋病、梅毒等疾病的患者，且平时未在大便、尿液等污染物上停留，小飞虫本身未携带有病毒，这种情况下吃了厕所的小飞虫可能就不会有病毒，患者不必过于担心，平时应注意清洁卫生，并注意饮食，尽量吃干净的食物；厕所的小飞虫如果咬过患有艾滋病、梅毒等疾病的患者，平时经常在大便、尿液、腐烂食物等污染物上停留，且本身属于有毒的虫，携带有致病菌，这种情况下吃了厕所的小飞虫就可能会有病毒，患者应注意观察自身身体的情况，如果出现不适，应及时去医院就诊，以免延误病情，影响身体健康。
