白茯苓与赤茯苓在药用上主要差异在于来源部位、归属的经络系统、特有功效、炮制方法、适用病症等方面，使用时务必遵循医嘱。
1、来源部位：白茯苓采自茯苓菌核的中心，纯白的实体部。赤茯苓特指茯苓菌核外层的红色部分。
2、归属的经络系统：白茯苓具有多向归经特性，主要影响心、脾、肺和肾经络。赤茯苓入心经、脾经和膀胱经是人体内的两条主要经络，两条经络在中医理论中都比较重要。
3、特有功效：白茯苓具有显著的健脾渗湿作用，倾向于滋养性质的药效。赤茯苓具有显著的清热利湿作用，药性倾向于清爽。
4、炮制方法：在炮制过程中，二者经历了不同的处理方式，该差异也进一步影响了性质和功效。
5、适用病症：白茯苓常用于治疗水肿尿少、痰饮眩悸、脾虚食少、便溏泄泻、心神不定等；赤茯苓更多用于湿热淋浊、带下等病症。根据其不同的功效，适用于不同的疾病状况。
患者必须遵医嘱谨慎服药，避免药物选择不当，导致治疗效果受阻。
