副作用和毒性反应的区别主要是副作用的影响通常比毒性反应更小，部分副作用和有效改善，毒性反应的改善效果不明显。
副作用指应用药物后所出现的，治疗目的以外的药理作用。药物毒性反应是指药物引起的严重功能紊乱和器质损害的严重不良反应。化学药、中药、中成药等药物通常都有副作用，具体的情况存在个体差异，但是是否存在毒性反应比较难确定，通常副作用的影响比毒性反应更小。常见的副作用包括胃肠道症状，主要是恶心、上腹饱胀、消化不良等，还有一些药物的副作用表现在过敏反应，如药物性皮疹或者喘息。而药物毒性反应则是严重的不良反应，如过久应用链霉素、庆大霉素，有明显毒性，表现在耳鸣、眩晕、耳聋等。毒性反应对身体危害较大，可累及中枢神经、造血系统、心血管系统，造成肝肾损害等。
有些药物副作用是可以采取手段减轻的，如应用了糖皮质激素，能够增加胃酸和胃蛋白酶的分泌，对于需要大剂量、长期使用糖皮质激素的患者，通常会给予抑制胃酸分泌的药物，来降低消化性溃疡发生风险，而毒性反应较难改善。
药物的使用需要严格按照医嘱进行，不能自行用药。
