男性生殖器长肉芽，可能是尖锐湿疣、珍珠状阴茎丘疹、传染性软疣、皮脂腺异位症、阴茎癌等原因引起的，建议及时就医并遵医嘱治疗。
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。病毒在生殖器部位的皮肤黏膜上皮细胞内复制、增殖，导致细胞异常增生，形成乳头状、菜花状或鸡冠状的肉芽，质地柔软，表面湿润，易出血，可伴有瘙痒、疼痛等症状。可外用咪喹莫特乳膏，刺激局部免疫反应以清除病毒；鬼臼毒素酊，腐蚀疣体；还可采用激光、冷冻等物理治疗方法去除疣体，同时可口服转移因子胶囊提高机体免疫力，预防复发。
2.珍珠状阴茎丘疹：病因不明，可能与局部刺激、生理发育变异等有关。主要发生在阴茎冠状沟边缘，为白色、肤色或淡红色的珍珠状丘疹，呈半透明状，形似肉芽，互不融合，无自觉症状。一般无需特殊治疗，若患者有治疗需求，可选择激光、冷冻等方法去除，药物治疗通常效果不佳。
3.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染所致，通过直接接触或间接接触传播。病毒在生殖器皮肤表皮细胞内生长繁殖，形成半球形丘疹，中央有脐凹，表面有蜡样光泽，可挤出白色乳酪样物质，类似肉芽，可单发或多发，一般无明显疼痛或瘙痒。可在局部消毒后用镊子夹除疣体，然后涂抹碘酊；也可外用维A酸乳膏，促进疣体脱落；口服抗病毒药物包括利巴韦林片（需谨慎使用，有一定副作用），辅助治疗。
4.皮脂腺异位症：由于皮脂腺发育的生理性变异和皮脂腺增生所致。在阴茎、阴囊等部位出现针头大小、孤立的黄白色小丘疹，可群集分布，类似肉芽，无自觉症状，一般不会恶变。通常无需治疗，若影响美观，可采用激光、电灼等物理方法去除，药物治疗基本无效。
5.阴茎癌：与包茎、包皮过长、HPV感染、吸烟等多种因素有关。阴茎头部或包皮内板出现菜花状、乳头状肿物，质地较硬，易出血、溃疡，可伴有恶臭，形似肉芽。需早期诊断并进行手术治疗，如阴茎部分切除术或全切除术，术后可能需要辅助放疗、化疗等，药物包括顺铂、氟尿嘧啶等用于化疗，但具体方案需根据病情由肿瘤科医生制定。
使用上述药物时务必谨遵医嘱。日常护理要注意保持生殖器清洁卫生，避免不洁性行为，使用安全套；若有包皮过长或包茎，建议择期手术；定期进行生殖器检查，早发现早治疗。
