孕酮是一种由卵巢黄体分泌的天然孕激素，而孕酮为5.9nmol/L是否正常取决于女性处于哪一时期，如果处于排卵期，一般正常；如果处于妊娠期，通常不正常。具体分析如下：
1.正常：排卵期通常是指排卵日加排卵日的前5天和后4天的时期，其孕酮的正常值一般在1.0-11.2nmol/L之间，所以如果处于这一时期，孕酮为5.9nmol/L通常正常。
2.不正常：如果女性处于妊娠期，孕酮的正常参考范围通常在52.7-100.1nmol/l之间，因为孕酮为5.9nmol/L远远低于正常值，所以在这种情况通常不正常。建议女性去医院检查，必要时可以按医嘱使用黄体酮注射液、黄体酮栓、黄体酮软胶囊等药物进行治疗。
